十二指腸潰瘍表現為空腹時上腹疼痛，此外，上腹痛通常也會呈現出慢性、週期性、節律性特徵。但部份有潰瘍灶的患者無症狀。發作時，腹部可有局限、固定的壓痛點。疾病緩解期多無明顯症狀。典型症狀：為反復發作的上腹痛，鈍痛、脹痛、灼痛等，在空腹時發作。慢性病程，可長達數年甚至10餘年；反复或週期性發作，發作有季節性（秋冬、冬春之交多見），發作期可為數週或數個月；節律性，與進食有關，多見於空腹（飢餓）時發作，進食後腹痛可緩解，可有夜間痛，服用抑酸劑後腹痛也可緩解。伴隨症狀：反酸、燒心等胃液分泌過多症狀；上腹脹、上腹不適、食慾減退、噯氣等消化不良症狀；腹瀉、便秘、下腹痛等腸道症狀。